לרשות היחידה חמש מערכות ממוכנות של כרומטוגרפיה נוזלים (AKTA systems), המיועדות לפיתוח שיטות ההפרדה ולהפקות בהיקף גדול וגם לבדיקות אנליטיות של רמת ניקיון החלבון.
מערכת AKTA נוספת מצומדת למערכת פיזור אור ומשמשת לאנליזות כמותיות, בין היתר חישוב גודל החלבון, ורמת ניקיון הדוגמה.

בנוסף, עומד לרשותנו ציוד להרצת חלבונים בג'לים, מכשור לצורך שבירת תאים, מערכות אולטרא-סינון כגון TFF ו- AMICON, ומגוון רחב ביותר של קולונות ורזינים  לצורך ניקוי חלבונים על-פי גודל, מטען, הידרופוביות או קישור ספציפי.

ביחידה גם מכשיר ITC (isothermal titration calorimeter) המיועד לכימות אינטראקציות בין חלבונים/פפטידים/דנ"א/מולקולות קטנות וחומרים ביולוגיים נוספים. מן הנתונים ניתן לחשב קבועי קישור (Kd), אנרגיית קישור סטוכיומטריה ועוד.